原为兴化职业大学和莆田高等专科学校
莆田高等专科学校前身为兴化职业大学和莆田师范大专班，
莆田学院
创办于1985年1月，初址借用涵江区黄霞坡驻军营房。时莆田市政府成立兴化职业大学建校筹备小组，同年1月，省教育局批设莆田师范大专班，寄托在兴化职业大学管理。同年3月，学校正式开学。开设师专中文、英语、地理、生物专业，招收166名学生入学；开设职专文秘、英语专业，招收100名学生入学。生源来自省内闽南地区10余县。
1986年择定城厢区梅峰街太平山为校址，兴建校舍。1987年秋季，迁至太平山新校舍。并相继成立中共委员会、共青团委员会。同年，成立兴化大学教育基金会，林文豪任董事长。
1988年，增设职大财会专业，1989年增设职大装潢美术专业，并逐渐扩大学校建设规模。先后兴建教学楼1幢、膳厅1幢、学生宿舍2幢、图书馆1幢、教师集资房楼1座，扩充实验室设备，举办兴大复合肥厂1所。
1991年6月，经国家教委批准，兴化职业大学、莆田师范大专班，省电大莆田分班、莆田市教师进修学院合并，定称莆田高等专科学校，校址以原兴化职业大学为校址。
原福建医科大学莆田分校
光绪二十六年（1900年），英国人雷腾于莆田县城内半门街设兴化圣教医院附属看护训练班。民国4年，兴化圣教医院附属看护学堂改称莆田圣路加医院附属看护学校。民国7年，圣路加医院于莆田县城北门街设产科学校。民国26年，圣路加医院附属看护、产科两校合并，称莆田县私立圣路加高级助产护士职业学校，校址仍在城内北门街。1952年，莆田县人民政府奉令接办私立圣路加高级护士助产职业学校，并改称莆田卫生学校。1969年，莆田卫生学校停办。1979年，复办莆田卫生学校，改称莆田地区莆田卫生学校。1982年改称福建省妇幼卫生学校。1995年在原福建省妇幼卫生学校基础上组建而成福建医科大学莆田分校。
原莆田华侨体育师范学校
1979年，于城厢设莆田地区师范学校莆田分校。1984年，莆田地区师范学校莆田分校改办为莆田华侨师范学校，迁址城厢区下磨村 旗盘山。1993年6月，更名为莆田华侨体育师范学校。
原仙游师范学校
仙游师范学校的前身是1902年由金石山书院改办的官立金石小学堂。1950年，仙游县政府奉令接办省立仙游师范学校。1969年，仙游师范学校停办。1972年，仙游师范复办，改称莆田地区师范学校。1982年莆田地区师范学校改称福建省仙游师范学校 。
合并建校
2002年3月兴化职业大学、福建医科大学（莆田分校）、福建高级妇幼卫生学校、莆田高等专科学校、莆田市教师进修学院、莆田华侨体育师范学校经国家教育部正式批准合并升格为莆田学院。2013年10月，仙游师范学校并入莆田学院。
据2014年4月官网显示，学校设有莆田学院文化与传播学院、莆田学院外国语学院、莆田学院数学学院、莆田学院环境与生物工程学院、莆田学院机电工程学院、莆田学院信息工程学院、莆田学院土木工程学院、莆田学院工艺美术学院、莆田学院音乐学院、莆田学院体育学院、莆田学院管理学院、莆田学院商学院、莆田学院基础医学院、莆田学院护理学院、莆田学院药学与医学技术学院、莆田学院附属临床学院、莆田学院基础教育学院等17个二级学院。
开设有汉语言文学、广告学、新闻学、数学与应用数学、信息与计算科学、英语、日语、机械设计制造及其自动化、电气工程及其自动化、计算机科学与技术、电子信息工程、测控技术与仪器、通信工程、应用化学、生物技术、人文地理与城乡规划、环境工程、土木工程、工程管理、工程造价、音乐学、工艺美术、美术学、体育教育、环境设计、视觉传达设计、财务管理、会计学、市场营销、旅游管理、人力资源管理、公共事业管理、临床医学、护理学、药学、医学影像技术等36个本科专业。
现任校长：李永苍
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