1933年，昆明医科大学前身的东陆大学医学专修科建立。
1956年，昆明医科大学建院。
1977年，恢复高考招生。
1981年，成为全国首批硕士学位授予单位。
1993年，被列为省属重点院校。
1996年，获准具有开展在职人员以同等学力申请硕士学位工作资格。
1998年，获准为博士学位授予单位。
2000年和2003年，分别成为临床医学、口腔医学硕士专业学位授权试点单位。
2005年，昆明医科大学药学院招收药学专业硕士生。
2006年，批准为开展推荐优秀应届本科毕业生免试攻读硕士研究生工作单位。
2007年，在教育部本科教学工作水平评估中获得优秀。
2009年，获公共卫生专业硕士学位授予权。
2010年，新增第二个博士后科研流动站。
2011年，获临床医学一级学科博士学位授予权，拥有医学副教授职称评审权和留学生招生权。
2012年，经教育部批准更名为昆明医科大学。
2013年10月，举办“昆明医科大学建校80周年校庆“系列活动。
院系设置
基础医学院 卫生检验、营养学
公共卫生学院 预防医学、公共事业管理
口腔医学院 麻醉学、口腔医学
法医学院 预防医学专业
药学院 药学专业、药物制剂
护理学院 临床药学、护理学专业、康复治疗学
人文学院 法医学
继续教育学院 市场营销
高等职业教育学院 法学专业（医事法学方向）
海源学院 劳动与社会保障专业（医疗保险方向）
临床肿瘤学院 临床医学、临床医学专业(肿瘤方向)
国际教育学院 公共事业管理专业（卫生事业管理方向）
第一临床医学院 医学影像学、医学检验专业
第二临床医学院 卫生检验、公共卫生与营养学
现任校长：姜润生
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