1950年，皖北高级农林学校创建。
1952年，紫连山林校并入皖北高级农林学校。
1952年，皖北高级农林学校紫连山林校更名为凤阳农业学校。
1960年，凤阳农业学校升格为凤阳农业专科学校。
1960年，安徽农业专科学校以及芜湖农业专科学校、屯溪茶叶专科学校、宿县农业专科学校等3校的农学专业并入凤阳农业专科学校。
1958年，安徽农业专科学校创建。
1965年，安徽农学院（牧医系）、凤阳农业专科学校合并组建安徽农学院（凤阳分院）。
1981年，安徽农学院（淮北分院）并入安徽农学院（凤阳分院）更名安徽农学院（皖北分院）。
1981年，安徽农学院（皖北分院）升格为皖北农学院。
1985年，皖北农学院改建安徽农业技术师范学院。
2000年，安徽农业技术师范学院更名为安徽技术师范学院。
2005年，安徽技术师范学院正式更名为安徽科技学院。

学校现有15个教学院部，59个本科专业，涵盖工、农、管、理、文、医、法、经等学科门类，形成了以优势农科和新兴工科为重点，多学科相互支撑、协调发展的应用型学科专业体系。拥有2个国家级特色专业、4个国家级卓越工程师项目专业、6个省级特色专业、3个省级重点学科。

现任校长：陈士夫
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