1978年5月，运城师范专科学校筹建并招生。1983年7月，运城教育学院成立。1985年3月，河东大学开始筹建。
1989年12月，经原国家教委批准，山西省人民政府决定，运城师范专科学校与运城教育学院、河东大学（筹）合并组建运城高等专科学校。
1999年6月，运城高等专科学校启动“强校升本”工程；2000年8月，山西省人民政府正式向国家教育部申报以运城高专为基础，建立运城学院。
2001年3月，国家教育部专家组进入该校考察。王昕副省长会见专家组成员。
2002年1月9日，全国大学设置评议委员会在广西桂林举行会议，投票通过以运城高专为基础建立运城学院。2002年2月22日，国家教育部通知山西省人民政府，正式批准运城学院建立。4月5日，山西省人民政府正式行文批准独立设置运城学院。6月，“运城学院”印章正式启用。2003年3月10日，运城学院党政领导班子宣布成立 。
据2014年5月学校官网显示，该校设有运城学院中文系、运城学院外语系、运城学院美术与工艺设计系、运城学院物理与电子工程系、运城学院生命科学系、运城学院计算机科学与技术系、运城学院体育系、运城学院政法系、运城学院音乐系、运城学院应用数学系、运城学院应用化学系、运城学院机电工程系、运城学院经济管理系、运城学院教育与心理科学系、思政部、公共计算机教学部、国际教育学院、大学英语教学部、继续教育学院等15个系，3个公共教学部 。
现任校长：姚纪欢
