1946年，原国立山东大学医学院成立；
1956年，独立建制为青岛医学院；
1970年10月，青岛医学院整体搬迁到北镇办学；
1974年11月，设立青岛医学院北镇分院；
1981年9月，独立建制，改称北镇医学院；
1983年3月，随驻地更名为滨州医学院；
1985年，创办残疾人医学系；
2001年7月，滨州医学院在山东省烟台市建立新校区；
2002年9月，滨州医学院烟台校区投入使用；
2003年6月，学校获得硕士学位授予权，并于2004年招收了人体解剖与组织胚胎学、内科学、口腔临床医学3个专业首届硕士研究生；
2006年，在教育部本科教学工作水平评估中获得优秀成绩。
院系专业
截至2014年6月，滨州医学院设有临床医学院、基础学院、特殊教育学院、口腔医学院、护理学院、人文与社会科学学院、药学院、中西医结合学院、卫生管理学院、外国语与国际交流学院、继续教育学院、葡萄酒学院、康复医学院、老年医学院等14个院（系）。设有临床医学、临床医学（全科医学）、口腔医学、护理学、中医学、中医学（针灸推拿方向）、医学影像学、麻醉学、预防医学、生物技术、药学、信息管理与信息系统、法学（医事法律方向）、英语（医学方向）、应用心理学（临床心理学方向）、统计学（卫生统计学方向）、公共事业管理学、劳动与社会保障、医学检验、眼视光学、康复治疗学、市场营销、特殊教育、听力与言语康复学、生物制药、葡萄与葡萄酒工程等26个本科专业（方向）和临床医学、护理2个专科专业。
现任校长：王滨
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