2004年1月17日，南京理工大学向江苏省教育厅提交申请成立泰州科技学院的请示。2月2日，江苏省教育厅和泰州市人民政府联合发文，决定成立泰州市本科学院建设领导小组。
2004年4月16日，江苏省教育厅向教育部提交关于建立泰州科技学院的请示。6月14日，教育部发文同意，南京理工大学和泰州高教园区建设发展有限公司合作试办南京理工大学泰州科技学院。7月20日，南京理工大学泰州科技学院成立大会暨挂牌仪式在泰州宾馆举行 。
南京理工大学泰州科技学院设置了机械工程及自动化、电气工程及其自动化、计算机科学与技术、电子信息工程、国际经济与贸易、市场营销、会计学、土木工程、英语、制药工程等16个应用型学科专业、31个专业方向。
截止2008年学院设有机械工程系、化学工程系、信息工程系、土木工程系、经济管理系、基础科学部等五系一部，依托南京理工大学的学科专业基础，根据现代科学技术发展趋势和地方经济需求设置专业，设有机械工程及自动化、计算机科学与技术、电子信息工程、电气工程及其自动化、土木工程、化学工程与工艺、环境工程、市场营销、艺术设计、国际经济与贸易、英语、工业工程、信息管理与信息系统、会计学、人力资源管理、制药工程共16个本科专业。
现任校长：刘玉海
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