1958年，牡丹江医学院创立。
1997年，学校一次性通过原国家教委合格评估。
2006年，学校在国家本科教学水平评估中被专家组给予了优秀的评价。
2009年，学校经国务院学位委员会批准为新增硕士学位立项建设单位。
2013年，学校通过硕士学位立项建设单位整体验收。
2014年，学校开始招收基础医学、生物医学、临床医学硕士研究生。

院系专业
2014年官网显示，学校有基础医学院、临床医学院、医学影像学院、药学院、公共卫生学院、护理学院、卫生管理学院、成人教育学院、外语教学部、口腔医学院、体育教学部等11个院（部）。开设临床医学、医学影像学、麻醉学、医学检验学、护理学、康复治疗学、口腔医学、药学、制药工程、药物制剂、预防医学、信息管理与信息系统、公共事业管理、应用心理学、市场营销、医学影像技术、生物医学工程等17个本科专业。

现任校长：冯克俭

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