1935年，驻桂林省立医院附设护士班，1936年增设助产士班。
1942年，改名省立桂林高级护士助产学校，开设护士、助产两个专业。
1951年，改为广西第二卫生学校。
1952年秋，改名为广西省立桂林卫生学校，迁址乐群路李子园。
1958年，广西省立桂林卫生学校升格为桂林医学专科学校。
1987年元月，经国家教委批准，升格为桂林医学院。
2015年，整体搬迁至临桂校区，乐群校区将归入附属医院
2006年获得硕士学位授予权。
2007年在教育部本科教学工作水平评估中获得优秀。
2012年通过教育部临床医学专业认证。

据2014年4月学校官网显示，学校设有基础医学院、临床医学院、南溪山临床医学院、第二临床医学院、药学院、生物技术学院、护理学院、继续教育学院、国际教育学院、医学检验系、口腔医学系、预防医学系和人文社科与管理学院、大学外语部、体育部16个二级学院（系、部）。

现任校长：雷 迅

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