1936年广东汕头水产职业学校创建。1936年广东汕头高级水产职业学校改名为广东省立高级水产职业学校。1939年日军攻占汕头，学校停办。1945年广东省立汕头高级水产职业学校复校并改名为广东省立汕尾高级水产职业学校。
1950年改名为广东省立高级水产技术学校。1952年改名为广东省水产技术学校。1953年广东省水产技术学校轮机专业并入长江航务学校，后发展为武汉河运专科学校、武汉交通科技大学，武汉理工大学等。1953年广东省水产技术学校、长江航务学校部分部分校区、广西钦州农业学校的水产科、海口高级农业技术学校的水产科合并组建广东省水产学校。1956年广东省水产学校改名为广东水产学校。
1960年广东水产学校升格为广东水产专科学校。1960年暨南大学的水产系，并入广东水产学校。1958年华南工学院（湛江分院）创建。1962年华南工学院的湛江分院，并入广东水产专科学校。1963年广东水产专科学校更名为湛江水产专科学校。1966年文革爆发，学校撤销。
1979年湛江水产专科学校复校并升格为湛江水产学院。1997年湛江水产学院、湛江农业专科学校合并并改名为湛江海洋大学。
1958年湛江气象学校创建。1966年湛江气象学校撤销，湛江气象学校一部分，并入成都气象学校。1979年湛江气象学校复校。2001年12月，湛江气象学校并入湛江海洋大学。2002年广东气象学校并入湛江海洋大学。
2005年湛江海洋大学改名为广东海洋大学。2010年6月，广东省与国家海洋局共建广东海洋大学。2013年8月，广东海洋大学正式获批为博士学位授予单位。
主要院系：水产学院、食品学院、农学院、海洋与气象学院等18个学院
现任校长：叶春海
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