1995年11月，由山东万杰集团出资、经山东省人民政府批准建立山东万杰医学院（筹）。
1999年3月，经教育部批准成为具有学历教育资格的民办普通高等院校——山东万杰医学高等专科学校，为山东省第一所民办高等院校，同年列入计划内招生。
1995—2008年，学院办学性质为私营企业所属的社会力量办学（民办）医药类高等专科院校。
2008年4月，经教育部批准升格为普通本科高等院校——山东万杰医学院，成为山东省第一所社会力量办学（民办）医药类本科高校。
2008年12月，被山东省人民政府直属大型国有企业山东省商业集团总公司（鲁商集团）接管，学校由私营企业社会力量办学转为国有企业社会力量办学。
专业一览
学科门类 专业名称 学历层次 学制
医学 临床医学 本科 五年
护理学 本科 四年
医学影像学 本科 四年
药学 本科 四年
药物制剂 本科 四年
医学检验技术 本科 四年
口腔医学技术 本科 四年
临床医学 专科 三年
护理 专科 三年
医学影像技术 专科 三年
药学 专科 三年
口腔医学 专科 三年
医学检验技术 专科 三年
针灸推拿 专科 三年
医疗美容技术 专科 三年
医学营养 专科 三年
管理学 财务管理 本科 四年
市场营销 本科 四年
信息管理与信息系统 本科 四年
电子商务 本科 四年
物流管理 本科 四年
医药营销 专科 三年
经济学 国际经济与贸易 本科 四年
医疗保险实务 专科 三年
工学 建筑环境与设备工程 本科 四年
食品科学与工程 本科 四年
食品质量与安全 本科 四年
电子信息工程 本科 四年
软件工程 本科 四年
医学影像设备管理与维护 专科 三年
理学 康复治疗学 本科 四年
现任校长：匡奕珍
