1949年10月，山东行政学院由华东工商干部学校、山东省教育行政干部学校以及南下干校（也称作南下工作队）合并成立，为省政府直属单位。省政府副主席郭子化兼任院长。校址位于济南市趵突泉公园内。

1955年4月，省委决定将山东行政学院、政治学校与党校合并建立中央第四中级党校。

1951年3月，省政府工业厅决定成立干部训练班。1957年10月，省人民委员会批准干部训练班与1956年4月建立的省手工业合作干部学校合并，组建山东省工业干部学校。1961年8月省工业干部学校撤销。1980年2月5日，省编制委员会决定重新建立山东省工业干部学校，1983年10月3日改建为山东省工业管理干部学院，1986年6月2日更名为山东省经济管理干部学院。1992年10月23日，省政府第123次省长办公会议确定在山东省经济管理干部学院的基础上建立山东行政学院，实行"一个机构，挂两块牌子"。副省长张瑞凤兼任山东行政学院院长。校址位于济南市燕子山东路。

2013年12月15日，省政府第21次常务会议确定对山东省经济管理干部学院、山东警察学院进行资源整合，山东行政学院独立办学。山东行政学院院长现由省委常委、常务副省长李群兼任，王卫东任党委书记、常务副院长。

机构设置

学院地处济南市风景秀丽的燕子山脚下，全院占地136000平方米，校舍建筑面积92000平方米，固定资产8483万元。学院成立以来，牢固树立为社会发展和经济建设服务的指导思想，坚持高标准、严要求，面向机关、面向企业、面向社会，抓住机遇，积极进取，不断拓宽办学路子，增强办学功能，各方面建设得到了比较快的发展。建院以来，累计培训各类干部学员4万多人次，其中培训各类公务员2800多人次；培养学历教育本专科生13000余名。现有教学、管理、党务机构共23个，其中教学系（部）9个，教学辅助机构4个。在职教职工260人，有专职教师135人，占教职工总数的52%。专职教师中教授14人，副教授58人；其他专业技术人员中，有正高级职称7人，副高级职称22人。学历教育专业20个，其中有6个本科专业。与国内知名大学合作，举办了行政管理研究生课程进修班和在职工商管理硕士教育。办学形式有脱产、半脱产、业余3种。办学层次有成人本科、专科和高职教育等。学历教育校内脱产生3900多人，函授生3600余人，开展全日制脱产专科（高职）专业，其管理模式与高校普通班级一样，学习期间完全脱离生产不在原单位工作，全身心的进行全日制学习。不占用学生周六和周日的时间，对学生有正常的、相对固定的授课教室和管理要求，有稳定的寒暑假安排，大大提高了办学效率。学院是省政府表彰的山东省职工教育先进单位和全省成人教育先进单位，被国家经济贸易委员会确定为“十五”期间全国第一批高级工商管理培训资格院校之一。