1958年，中山医学院湛江分院成立。
1964年，学校升格为五年制医学本科院校并更名为湛江医学院。
1970年1月19日，湛江医学院附属医院正式接诊病人。
1985年，国家教委同意学校招收病理生理学、生物化学、外科学(整形)专业硕士研究生7名。
1986年，学校正式获得7个学科硕士学位授予权。
1991年，获广东省办学水平评估一等奖。
1991年，学校连续三个五年计划被列为广东省重点建设大学。
1992年，易名为广东医学院。
1995年，高教厅投资710万元资助学校在原中心实验室的基础上建立了教学科研型实验中心——粤西高校分析中心。
1996年9月14日，与日本大阪高技术学院、大阪医疗技术学院合作办学。
2002年10月18日，广东省教育厅批准广东医学院创办东莞校区，当天，学校与松山湖管委会签定合作协议；11月，学校成立筹建东莞校区工作领导小组，并设立筹备建设办公室；12月12日，东莞校区奠基；2003年2月5日破土动工；同年10月23日，东莞校区首批新生顺利入学。
2009年，被广东省列为国家限额指标内的拟新增博士学位授予单位立项建设单位。
2013年，获临床医学一级学科博士点。
截止到2013年，学校设有研究生学院、基础医学院、第一临床医学院、第二临床医学院、医学检验学院、护理学院、药学院、公共卫生学院、人文与管理学院、信息工程学院、继续教育学院、社会科学部、体育教学部、外语教学部等14个学院（部）。
现任校长：郑学宝
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