1928年，于当时省会安庆市创建安徽大学。
抗战期间，因日军入侵，学校被迫西迁并曾一度停办。1945年抗日战争胜利后，安徽大学于安庆市复校，并援河南大学例，改为国立大学，定名国立安徽大学。著名学者姚永朴、刘文典、王星拱、程演生、陶因、陈望道、丁绪贤、郁达夫、周予同、吕思勉、章益、周建人等均曾在安徽大学执教或主持校政。
1949年12月迁至芜湖市，与安徽学院合并，恢复校名安徽大学。
1952年，思想改造运动以后，安徽省委决定，将安徽大学搬到省会城市合肥。为此，学校成立了基建领导小组，并迅速派出以徐连成、朱世雄为正、副科长的基建工作班子，到合肥从事新校基本建设工作。
1954年全国高校院系调整，安徽大学部分系科调往华东地区有关院校毛主席题写校名，同时调入一些系科，设师范、农学两个学院，并于1954年2月分别独立组建专门性的安徽农学院（现安徽农业大学）和安徽师范学院（现安徽师范大学），安徽大学建制取消。
1958年由原安徽大学派出的基建班子，在合肥西门外建设的新校已经落成。省委原拟将安徽师范学院迁往合肥新址办学，但是由于形势发展的变化和需求，省委决定师范学院仍留芜湖，在合肥新校另建“合肥大学”，曾希圣兼校长。并决定将安徽师范学院的主力系科物理系成建制的迁入合肥大学，只留少数教师继续在芜湖筹备新的物理系。其他系科包括中文、外语、历史、地理、数学、生物、化学等系只抽出少数骨干教师加上学校部分管理干部到合肥大学。
1958年7月5日，国务院第七次会议决定曾希圣兼任合肥大学校长，张行言、孙陶林任副校长。7月21日，省委决定成立合肥大学党委，由张行言任书记，原解放军南京军区师范学校政委方志明任第一副书记。同年9月16日，毛主席来到合肥视察， 并为安徽大学提名。安徽大学是毛泽东同志亲笔题写校名的为数不多的大学之一。
1993年，安徽省委、省政府响应党中央和国务院的战略部署，在国家计委和教育部的具体组织领导和大力支持下，决定重点支持安徽大学进入国家“211工程”。
1996年，安徽大学通过“211工程”部门预审。
1997年12月学校正式成为国家“211工程”重点大学，也是安徽省继中国科技大学以后的第二所“211工程”重点高校。
1998年经省政府批准实施“211工程”建设项目，同年李鹏、乔石等同志亲笔题词祝贺学校建校70周年。
1999年获准作为“211工程”项目院校在国家正式立项建设。
2000年，原安徽银行学校和安徽财政学校并入安徽大学。
2001年6月，在如期完成“九五”“211工程”建设任务的基础上，顺利通过了国家整体项目验收。同年，温家宝同志亲切接见了“全国十大扶贫状元”该校教师何家庆同志。
2002年11月7日和2003年9月17日学校《“十五”“211工程”建设项目可行性研究报告》和《仪器设备购置计划》分别通过了教育部专家组的立项审核和国家计委中国国际工程咨询公司专家组的考察评估。
2002年12月28日，占地2000余亩的磬苑校区举行了开工典礼，并于2004年开始进驻。
2004年6月，学校《“十五”“211工程”建设项目可行性研究报告》获得国家发改委批复，“十五”“211工程”建设项目正式在国家立项建设。
2006年6月顺利通过国家“十五”、“211工程”整体项目验收。
2007年11月学校以优秀成绩通过教育部本科教学工作水平评估。
2013年8月，成为安徽省与教育部共建高校，享受直属高校待遇。   

院系设置
截至2014年7月，安徽大学有26个院（系、部），开设87个本科专业。
数学科学学院数学与应用数学、信息与计算科学、应用统计学物理与材料科学学院应用物理学、材料物理、光电信息科学与工程化学化工学院化学、应用化学、化学工程与工艺、高分子材料与工程、材料化学、新能源材料与器件计算机科学与技术学院计算机科学与技术、软件工程、网络工程、信息安全电子信息工程学院电子信息工程、通信工程、微电子科学与工程、物联网工程生命科学学院生物科学、生物技术、生物科学（生物统计方向）、生物工程文学院汉语言文学、汉语国际教育历史系历史学哲学系哲学、应用心理学新闻传播学院新闻学、广播电视学、广告学、编辑出版学经济学院经济学、财政学、税收学、国际经济与贸易、金融学、经济统计学商学院会计学、工商管理、物流管理、人力资源管理、财务管理、电子商务、旅游管理 、市场营销外语学院英语、俄语、日语、法语、德语、西班牙语法学院法学管理学院档案学、管理科学、信息管理与信息系统、行政管理、劳动与社会保障、图书馆学社会与政治学院社会学、社会工作、政治学与行政学艺术学院视觉传达设计、环境设计、绘画、戏剧影视导演、音乐表演资源与环境工程学院环境科学、地理信息科学、地质学、测绘工程电气工程与自动化学院自动化、电气工程及其自动化、测控技术与仪器、机械设计制造及其自动化、工业设计文典学院人文科学试验班、人文科学试验班、经济管理

现任校长： 程桦

历任校长：黄德宽

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